Команда Вояджера, объединив свои усилия с боргами по противостоянию ранее не известной, но чрезвычайно агрессивной не гуманоидной формой жизни, получившей название "Вид 8472", достигает определенных успехов. Борги для обеспечения более лучшего взаимодействия его постоянного нахождения на борту Вояджера выделяют своего представителя. Так на корабле появляется Семь-из-Девяти.

    В организмах сразу двух женщин на корабле начинаются необратимые изменения. Семь-из-Девяти, оторванная от своего Коллектива боргов начинает выходить из строя, и Доктор вынужден сделать ей хирургическую операцию, удалив из ее организма практически всю технологию боргов. Тем временем Кэс страдает от рядя естественных для ее вида физиологических реакций, которые, учитывая ее экстрасенсорные способности, могут серьезно угрожать всему кораблю. Кэс решает оставить Вояджер.

    Есть у клингонов один замечательный праздник-ритуал, "День Чести" называется. И вот именно в это день Б'Елана Торрес и Том Пэрис оказываются в опасной для жизни ситуации.

    На планете, которую посещает Вояждер, уже много лет длиться кровопролитная война. Капитан Джанвей вынуждена вмешаться в эту войну, когда ее первый офицер Чакотай, оказывается серьезно ранен одной из враждующих сторон.

    Отправившись на помощь на чужой корабль, с которого постоянно передается сигналы SOS, Б'Елана Торрес и Док обнаруживают там мертвый экипаж и сошедшею с ума голографическую программу медицинской помощи.

    Семь-из-Девяти внезапно снова чувствует потребность вернуться в Коллектив боргов и творить там свои тёмные дела.

    Некая раса, представители которой смогут делать себя невидимыми, захватывают Вояджер и начинают серию своих экспериментов над членами экипажа корабля.

    Лидер цивилизации кремин - Анноракс, использует само Время как оружие, против своих врагов. В его власти стирает целые цивилизации из Времени.

    Практически уничтоженный Вояждер под руководством капитана Джанвей внезапно находит возможность противостоять креминам, получив неожиданное подкрепление.

    Визит на планету Мари, населенной цивилизацией телепатов, обернулся плачевно для Б'Еланы Торрес, которая оказалась арестованной на этой планете. Тувок оправляется спасать её из рук местного правосудия.

    Пиратский корабль захватывает основной компьютер Вояджера. Совершенно внезапно на помощь капитану Джанвей запертой в программе голопалубы приходит голографический Леонардо Да Винчи.

    Результатом исследовательской миссии становиться авария, в которой погибает Неликс. Семь из Девяти используя технологию боргов возвращает его к жизни, но сам Неликс, после воскрешения, считает, что он уже мертв и ему следует уйти в мир иной.

    Экипаж будоражит какими-то запредельными желаниями и мечтами. Вскоре обнаруживается что чужая раса использует мечтания команды чтобы захватить Вояджер.

    Док посылается по малопонятной системе связи в Квадрант Альфа с заданием сообщить в Федерацию, что экипаж Вояджера еще жив и стремиться к дому, но он оказывается на экспериментальном корабле Звёздного Флота, который захвачен ромулянами, что вносит некоторые коррективы в его планы.

    Корабль оказывается под угрозой захвата охотниками Хирогена, древней расы межгалактических хищников-охотников, которые выбрали Вояджер с качестве своей очередной жертвы.

    Оказавшись вовлеченными в противостояние Хирогенов и Вида-8472 капитан Джанвей вынуждена принять решение к какой из сторон присоединиться Вояджер.

    Торговец оружия Ковин предлагает установить на Вояджер новое, очень мощное вооружение, но все оказывается не так хорошо, когда капитан Джанвей начинает понимать что Семь из Девяти уже не первый раз встречает Ковина...

    Всему экипажу представляется возможность поучаствовать в смоделированной на голопалубе Второй Мировой Войне. Причём без их на то согласия.

    Доку и Гарри Киму удается вырваться из виртуальной войны которую устроили всей команде захватившие корабль Хирогены, и вернуть экипаж Вояджера в реальность.

    Двойник Тома Пэриса появляется на борту USS Вояджер, хоть он и выдает себя за реального лейтенанта Пэриса капитан Джанвей начинает подозревать подмену...

    "Директива Омега" - секретной пакет инструкций вложенных в компьютер каждого корабля Звёздного Флота. Эта директива срабатывает только в случае обнаружения сенсорами корабля частиц Омега (сверх-опасного вещества, которое может разрушать само Пространство). На Вояджере эта директива активизируется...

    Спасенная из космической аварии молодая женщина узнает в Чакотайе своего старого знакомого, но сам Чакотай уверен что он видит эту женщину впервые.

    Голографический Док активизируется в далеком будущем, через 700 лет после приключений Вояджера на планете в Квадранте Дельта. Он узнает что команда Вояджера в своё время уничтожила на этой планете миллионы местных жителей.

    Том Пэрис и Гарри Ким участвуют в разведывательном полёте на планету с чудовищно токсичной атмосферой, совершенно не приспособленную для жизни человека, но всё же имеющую своих жителей.

    Пока корабль проходит сквозь космическую туманность, с повышенным радиоактивным фоном вся его команда лежит в стазе. На мостике дежурит только Семь-из-Девяти.

    Удаётся расшифровать послание, которое пять месяцев назад было получено на Вояджере. С его расшифровкой стало возможным найти реальное средство попасть домой, на Землю, гораздо быстрее.