Орионский корабль нападает на грузовой корабль "Гурон", летящий на встречу с "Энтерпрайзом", и отбирает груз дилития и ценное лекарство без которого Спок умрёт. Загнанные в пояс взрывоопасных астероидов орионские пираты готовы к сделке, Кирк готов всё забыть и оставить пиратам груз дилития за лекарство для Спока. Но пираты не верят Кирку и готовятся уничтожить себя и "Энтерпрайз". Разоблачив планы пиратов Кирк получает и лекарство, и забирает в плен пиратов.

    Независимый наблюдатель Ари бн Бем с планеты Пандро, отправившись с десантом на планету Дельта Тета 3, ведёт себя очень странно, из за него Кирк и Спок попадают в плен к диким аборигенам. В плену выясняется, что Бем это колония нескольких организмов и способен разделится и убежать, но вместо этого он остается в плену и надсмехается над Кирком. Кирку и Споку удаётся бежать, но в ситуацию вмешивается планетный сверхразум, он требует, чтобы Кирк и Спок покинули планету. Они не могут сделать этого без Бема. Они находят Бема и объясняют разуму, что не могут бросить Бема, так как несут за него ответственность. Разум одобряет такое поведение людей, а Бему становится стыдно за свои слова.

    Спасаясь от трёх ромуланских кораблей "Энтерпрайз" пролетает через энергетическое поле, после этого на корабле начинают часто происходить разного рода розыгрыши. Это дело рук компьютера Энетрпрайза. Следующим объектом шуток становятся ромуланцы. Они бросаются в погоню за "Энтерпрайзом". Кирк приказывает снова пройти сквозь облако, это исправляет компьютер "Энтерпрайза", а шутки теперь происходят на ромуланских кораблях.

    Маккоя арестовывают на планете Дремия, его обвиняют в распространении смертоносной эпидемии на планете Дремия II. Кирк отправляется на Дремию II и находит там свидетелей невиновности Маккоя, но на обратном пути на борту корабля вспыхивает эпидемия. Только Спок остался здоров, у вулканцев иммунитет к заболеванию. Он тайком освобождает Маккоя из под ареста и поднимает его на "Энтерпрайз", там он находит способ остановить эпидемию и излечить команду. Благодаря этому и свидетелю с Дремия II, с Маккоя снимают обвинения и отпускают с миром.

    "Энтерпрайз" выясняет происхождение загадочного чужого космического зонда. По его следу Энетпрайз находит космический корабль хозяин которого не кто иной, как божество майя Кукулькан. Он заключает в энергетическую сферу "Энтерпрайз" и забирает к себе на борт Кирка, Маккоя, Скоти и рядового Идущего Медведя, команчи и знатока истории майя. На борту Кукулькан рассказывает, что он стоял у истоков древних человеческих цивилизаций и многому обучил людей. Он недоволен людьми и хочет снова их обучать. В это время Спок разрывает сферу и повреждает корабль Кукулькана, а Кирк уверяет его, что люди сами должны идти своим путём и Кукулькан покидает людей.

    "Энтерпрайз" перевозит на Вавилон, уходящего в отставку, посла Федерации, первого капитана "Энтерпрайза" коммодора Роберта Эйприла. Пролетая мимо сверхновой команда замечает сверхбыстрый корабль направляющийся прямо в центр звезды. Попытавшись остановить его тяговым лучом, "Энтерпрайз" пролетает через звезду и оказывается во вселенной, где всё наоборот, небо белое, а звезды чёрные, люди рождаются стариками, а умирают младенцами. Команда "Энтерпрайза" начинает стремительно молодеть, превращаясь в маленьких детей. Командование на себя принимает помолодевший Эйприл. "Энтерпрайз" возвращается в свою вселенную, снова пролетев через звезду.