Командование Звёздного Флота посылает команду во главе с капитаном Сиско в Клингонскую Империю. Возникли сильные подозрения, что канцлер Говрон, лидер клингонов, находится в сговоре с Доминионом. Это может сильно осложнить положение дел в квадранте Альфа.

    При изучении одного из миров Гамма-квадранта обнаруживается полуразрушенный военный корабль джем'хадар. Сиско хочет переправить звездолет на "Дип Спейс 9". Появившиеся джем'хадар хотят вернуть его себе. Конфликт интересов, однако.

    Ворф, Кварк и ещё один клингон увлечены одной и той же клингонкой. Их соперничество доходит до кровавого сражения. Правда, только на голопалубе.

    Джек Сиско воочию сталкивается с ужасами войны. Ему надо перебороть свой страх и неуверенность.

    В жену шефа О'Брайна вселяется какой-то чужеродный дух. Эта сущность требует выполнения О'Брайном некоторых требований, угрожая убить своего носителя - Кейко О'Брайн.

    Клингонский террорист проникает в прошлое, на первый из Энтерпрайзов с намерением убить капитан Керка. Вместе с ним в прошлое попадает и Сиско со товарищами, который должен помешать злобному клингону. На Энтерпрайз они попадают в тот момент, когда команда корабля вовсю борется с размножающимися триблами. ("Неприятности с триблами", TOS)

    Любовные терзания Ворфа по отношению к Дакс выводят его на обнаружение экстремистской организации, борющейся за восстановление "моральных и культурных традиций Федерации".

    Сиско, Одо и Дакс опять оказываются в переделке. На это раз они попадают на "Дип Спейс 9" во времена владения его кардассианцами.

    Одо и Кварк остаются один на один с дикой природой незнакомого мира. Давние соперники смогут выжить только доверившись друг другу.

    Баджор собирается вступить в Федерацию Планет, а Сиско, тем временем, нехитрыми махинациями, обнаруживает как можно увидеть будущее Баджоры.

    Кто-то начинает убивать баджорцев, в свое время входивших в сопротивление Шакара. Кира, тоже, входящая в ветераны сопротивления, начинает волноваться.

    Станция переполнена новостями. Вся суета на станции происходи по вине детей, не обязательно человеческих, не обязательно еще рожденных, но беготни из-за них уже изрядно. А у Одо праздник: познав горечь быть твердотельным он снова получил возможность морфировать как душе угодно.

    Сиско обеспокоен новыми атаками макки на кардассианские миры. Проникнув в лагерь макки Сиско встречается с местным полевым командиром, бывшем офицером Звёздного Флота, который и планирует эти атаки.

    Реагируя на сигнал бедствия кардассианского корабля из квадранта Гамма, Ворф и Гарак оказываются в тюрьме джем'хадар, накануне атаки Доминиона в квадранте Альфа.

    Флот джем'хадар вторгается в пространство кардассиан. Гул Дукат переходит на сторону Доминиона, вместе с ним вся Кардассианская Империя подчиняется новым хозяевам.

    Одо помогает молодой женщине, которая оказывается агентом Ориона.

    Кузен Кварка предлагает тому довольно выгодную сделку по перепродаже оружия. Это может принести фантастическую прибыль, но что-то в этом предложении настораживает Кварка.

    Кардассианский диссидент Текени Гхемор, узнаёт в Кире свою дочь, которая была изменена внешне благодаря хирургической операции. Он умирает и по кардассианским обычаям он должен исповедоваться перед смертью своему самому близкому родственнику. В этом случае Кира может узнать множество секретов кардассианцев.

    Кварк хочет использовать любовные отношения между своей матерью и Великим Нагусом в корыстных целях, для поднятия своего положения в Торговом Альянсе Фаренги.

    Генерал Матрок получает приказ от Клингонского Высокого Совета найти потерянный корабль, пропавший у границы с кардассианцами. В этой миссии к нему присоединяются Ворф и Дакс.

    Экипаж "Дефайента" высаживается на очередной странной планете, чтобы обнаружить, что на ней живут потомки этого экипажа. Руководит колонией Миранда О'Брайн. Есть тут и потомки Дакс, Сиско и всех остальных. Произошло непредвиденное. Экипаж с "Дип Спейс" был здесь в прошлом, 200 лет назад! И они остались тут - навсегда.

    Макки опять пытаются одолеть кардассиан, послав на них несколько торпед. Теперь только Кардассия член Доминиона. И ответный удар скорее всего коснется не только макки. Развернётся полномасштабная война против Федерации.

    Шеф О'Брайн и Гарак летят на "Эмпок Нор", заброшенную космическую станцию, идентичную "Дип Спейс", за некоторыми деталями, вышедшими из строя.

    Джек Сиско решает любой ценой получить редкую бейсбольную карточку, которую Кварк собирается продать на аукционе.

    Флот Доминиона и Кардассианской Империи решаются на прямое нападение на "Дип Спейс 9". Начинается война.