Обострение угрозы войны с Доминионом возрастает, также возрастает опасность нарушения мирного договора Федерации с Клингонском Империей. Капитан Сиско просит командование Звёздного Флота прислать на станцию лейтенант-коммандера Ворфа, единственного в Звёздном Флоте клингона, для облегчения дипломатических отношений с его расой. Просьбу удовлетворяют.

    Продолжение. Ворф вживается в новый коллектив. Ему приходится делать выбор между Звёздным флотом и расой, к которой он принадлежит по крови - клингонам.

    Авария на Дефайенте перебрасывает Сиско на десятилетие вперед во времени. Сиско видит своего повзрослевшего сына.

    О'Браен и доктор Башир захватываются группой воинов-мятежников джем'хадар, которые просят Башира помочь им.

    Гал Дукат присоединяется к Кире в поиске уцелевших после аварии тюремного кардассианского корабля, и он должен принять трудное решение о жизни своей дочери.

    Джадзия Дакс встречается с соплеменником, с которым её прочно связывает прошлое их триллов.

    Столкновение с джем'хадар серьёзно повреждает "Дефайент", подвергая серьезной опасности всю его команду.

    Трое ференгов во главе с Кварком попадают в прошлое, на Землю в 1947 год, где местное население их воспринимает как захватчиков с Марса.

    Кор, клингонский воин, просит у Ворфа оказать ему помощь в поисках легендарного меча Императора Кахлесса, реликвии, способной вновь сплотить всех, сейчас разъединенных, клингонов вместе. Но не только они заинтересованы в этой находке.

    Доктор Башир иногда развлекается тем, что играет на голопалубе в супер-крутого шпиона двадцатого века, аля Джеймс Бонд. Авария телепорта переводит все руководство станции в цифровую форму и они попадают в программу к Баширу. Чтобы вытащить друзей из этой неприятности доктор Башир должен показать верх крутизны, ведь дело происходит в жестоком 20 веке, и хоть он и виртуален, но остальным то от этого не легче.

    Когда подтверждаются опасения, что Основатели уже находятся на Земле, Сиско объявляет полную готовность к войне с Доминионом.

    В душе Сиско закрадывается подозрения, что реальная угроза Федерации может быть главным образом исходить и не от Основателей, а изнутри самой Федерации.

    Выполняя свои обязанности по обеспечению безопасности Первого Министра Баджоры - Шакары, Одо начинает ревновать его к майору Кире, с которой Министра очень многое связывает.

    Кира и Гал Дукат, теперь пониженный в должности до капитана грузового корабля, выслеживают клингонскую Хищную Птицу, которая участвовала в уничтожении мирного форпоста на кардассианской границе.

    Брат Ворфа, Курн, прибывает на "Дип Спейс 9" с просьбой к Ворфу чтобы тот убил его. По клингонским законам ритуальное убийство опозоренного клингона должен совершить его близкий родственник.

    Официанты и другие работники Кварка объединяются и объявляют забастовку против бесчеловечных действий своего шефа. Кварк озадачен, ранее он не сталкивался с такими проблемами в бизнесе.

    Из Измерения выходит баджорский корабль, который пропал более двух столетий назад. Единственный пассажир на этом корабле, поэт Акорем Лаан, авторитетно заявляет, что его послали Пророки наводить порядок на Баджоре. Вначале ему поверили.

    Ворф обвиняется в уничтожении гражданского клингонского корабля.

    О'Брайну ввели в память что он 20 лет провел в тюрьме. Это такой способ наказания в одной цивилизации, которой Шеф чем-то не угодил. Воспоминания его 20-летней отсидки настолько реальны для него, что это начинает влиять на его жизнь на станции.

    Повстанцы альтернативной вселенной опять нуждаются в помощи. На этот раз они посылают на "Дип Спейс 9" Дженнифер, жену Сиско, двойник которой в нашей вселенной уже давно мертв.

    Одо помогает Лваксане Трой сохранить её ещё не родившегося младенца.

    Сиско потрясён, когда догадывается, что его подруга, Кэсиди Ятис, может быть контрабандисткой-макки.

    Станция оказывается атакованной мятежниками-ренегатами джем'хадар, которые не подчиняются Доминиону. В отместку Сиско совместно с истинными джем'хадар отправляется искать пиратов.

    Кира, Дакс и доктор Башир пытаются помочь жители небольшой планеты, которая 200 лет назад была обработана бактериологическим оружием воинами джем'хадар.

    Когда у Кварка обнаруживается неизлечимая болезнь, он заключает контракт на продажу частей своего тела, тем самым обеспечив будущее своих родственников, но когда оказывается что смертельный диагноз был поставлен неправильно, Кварк уже не может оказаться от сделки, весь у ференги сделка священна.

    Одо, по природе метаморф, внезапно стал не в состоянии поддерживать свою твердую форму, постоянно превращаясь в аморфную лужицу. Сиско принимает решение отправить его к своему виду - Основателям. Только они смогут, если конечно захотят, помощь Одо снова обрести себя. Но, Основатели решили по другому. Они забрали у Одо способность морфировать, по сути сделав его обычным человеком...